Tri moćna europska superračunalna centra – smještena u Bologni, Barceloni i Jülichu – sudjelovat će u projektu Exscalate4CoV, zajedno s farmaceutskom tvrtkom i nekoliko velikih bioloških i biokemijskih instituta. Projekt je pokrenut nakon hitnog poziva Europske komisije za iskazivanjem interesa 31. siječnja 2020. i dobit će sredstva vrijedna 3 milijuna eura za istraživanje razvoja, liječenja i dijagnostike cjepiva za Covid-19. Projekt je dio koordiniranog odgovora EU-a , čiji je cilj raditi na konkretnoj platformi za pronalaženje lijeka koji bi se koristio protiv novog koronavirusa SARS CoV-2.

Ovo financiranje iz EU-a pojačalo je rad sa superračunalima na istraživanju liječenja lijekovima za Covid-19, nadopunjujući klasični klinički pristup ispitivanja i pogreške i moguće eksperimentiranje na pacijentima. To se postiže usporedbom proteina virusa SARS CoV-2 s molekulama koje su pohranjene u bazama podataka.

Excalate4Cov sada obrađuje digitalne modele proteina koronavirusa i uspoređuje ih s bazom podataka o tisućama postojećih lijekova, s ​​ciljem otkrivanja kombinacija aktivnih molekula koje mogu reagirati na virus. Drugi primjer potpore EU vidi se time što je Partnerstvo za napredno računarstvo u Europi (PRACE) 24. ožujka 2020.  objavilo poziv za podnošenje prijedloga projekata, tražeći računalne resurse da doprinesu ublažavanju utjecaja pandemije virusa SARS CoV-2.

EXSCALATE platforma – jedan od rezultata projekta kojeg financira EU Antarex – potpuno je operativan u talijanskom Superračunalo centar CINECA, analizirajući proteine SARS CoV-2 na temelju podataka dostupnih iz znanstvene zajednice, kako bi ubrzao potragu za učinkovitu terapiju protiv virus pandemije.

Ostale europske inicijative za računanje također su dale svoju podršku tijekom izbijanja zaraze Covid-19. Primjerice, primjene HPC-ovog centra izvrsnosti za računalno biomolekularno istraživanje BioExcel već se mogu koristiti za zahtjevnu, virtualnu provjeru potencijalnih medicinskih spojeva, poput lijekova s ​​malim molekulama i antitijela. Unatoč primjenjivosti ovisno o konkretnom slučaju pandemije, politika pristupa Zajedničkog poduzeća EuroHPC predviđa prioritetni i neposredan pristup svojim superračunalima u slučaju nužde, kao što je slučaj u pandemijskim krizama s kakvom se sada suočavamo.

 

Izvor: https://www.bug.hr/